Os ABO aceitam os seguintes formatos de artigos científicos para revisão por pares: Artigo original, Relato de caso, Atualização Médica Continuada e Carta ao Editor.

O processo de avaliação do artigo inicia-se na Secretaria  dos ABO com a verificação do envio concomitante da carta de cessão de direitos autorais aos ABO (copyright), da declaração de isenção de conflito de interesse, da declaração de contribuição de autores e patrocinadores e, finalmente, da carta de aprovação do comitê de ética em pesquisa da instituição onde o estudo foi realizado. Após a verificação inicial, o trabalho é enviado para o Editor Associado, especialista na área de interesse do artigo científico, que será o responsável pelo processo de revisão, como um todo. O Editor Associado, por sua vez, seleciona revisores do Conselho Editorial nacional e internacional e, quando necessário, revisores ad hoc, que farão a avaliação do artigo submetido. Pelo menos dois revisores são selecionados.

Uma vez completa a revisão pelos pares, o Editor Associado faz a crítica e síntese da revisão, enviando seu parecer final ao Editor-Chefe dos ABO, que revê todo o processo (revisões e comentários) e toma a decisão editorial final. A decisão final é então enviada por e-mail para o autor correspondente.